方实验室论文

Natural display of nuclear-encoded RNA on the cell surface and its impact on cell interaction

Huang, N.; Fan, X.; Zaleta-Rivera, K.; Nguyen, T.; Zhou, J.; Luo, Y.; Gao, J.; Fang, R.H.; Yan, Z.; Chen, Z.; Zhang, L.; Zhong, S.

Genome Biology 2020卷 21225

论文简介

这项发现性研究询问:由细胞核编码的RNA是否能够稳定展示在细胞外表面,并参与细胞间相互作用。作者开发Surface-seq选择性测序膜相关胞外RNA,并用RNA荧光原位杂交验证其中两个候选。为判断人外周血单个核细胞中的细胞类型特异性,他们把胞外反义寡核苷酸标记、成像流式、单细胞RNA测序和表面RNA测序结合起来。结果显示,单核细胞是主要的表面RNA阳性群体,综合分析筛出11个候选分子用于功能实验。针对暴露在表面的FNDC3B或CTSS转录本给予反义寡核苷酸后,单核细胞与血管内皮细胞的黏附下降。主要发现不只是在细胞外侧检测到核编码转录本,还证明至少两个此类信号会影响明确的细胞—细胞行为。其意义是把细胞表面功能组分从蛋白、糖和脂质扩展到RNA,并提出新的标志物和干预靶点。摘要尚未说明这些RNA如何锚定、运输和调控,也不能确定反义分子的具体作用机制。