Biomimetic virulomics for capture and identification of cell-type specific effector proteins

论文简介

本研究建立一种面向特定宿主细胞类型的病原体效应蛋白筛选流程。其出发点是，单纯依赖基因组的筛选可能因基因与实际功能蛋白组之间不完全一致，而漏掉具有生物学意义的毒力因子。作者提出“仿生毒力组学”，把细胞来源的仿生亲和材料与多重定量蛋白质组学结合。仿生材料提供类似目标宿主细胞的结合界面，先富集能够发生相关相互作用的病原体蛋白，再通过蛋白质组方法进行规模化鉴定。该策略用于原核和真核病原体后，能够以细胞类型为导向捕获已知毒力因子；研究还对用于捕获的仿生材料膜蛋白组成进行了表征。其主要贡献是把毒力因子发现从序列线索推进到功能性结合富集，可能比仅看基因更聚焦于可作用于目标细胞的候选药物靶点。但摘要没有列明病原体范围、候选数量、富集准确性、假阳性率、独立功能验证或与既有筛选方法的比较。被捕获只说明存在亲和作用，并不能证明该蛋白必然导致疾病，后续药物发现价值仍需验证。